医院耳鼻咽喉头颈外科是国家临床重点专科、江苏省级临床重点专科、南京市重点专科。该科室以“功能与微创”为原则，全面开展耳、鼻、咽喉及头颈部常见病及疑难性疾病的诊治，为我院的龙头学科之一。该科室60%-70%的患者来源于南京以外的城市，覆盖全国27个省份；三、四级手术占85%。科室致力于改善疾病的治疗和结果的研究，推动新治疗策略的开发，已有诊疗中心包括：头颈肿瘤诊疗中心、儿童腺样体扁桃体专病诊疗中心、眩晕诊疗中心、甲状腺疾病诊疗中心、睡眠呼吸疾病诊疗中心、过敏性鼻炎哮喘变态反应研究中心、耳鼻喉微创中心、电子耳蜗植入中心、嗓音疾病治疗中心等.在医院首席专家、中国著名头颈肿瘤专家于振坤教授和旅美博士后何双八的带领下，医院耳鼻咽喉头颈外科已发展成拥有一支能代表国内一流水平且年轻的耳鼻咽喉专业队伍，其临床技术实力、科研创新能力、专科品牌影响力领跑省内甚至辐射至长三角地区。
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